容姿端麗、最強無敵學生會長黑神目瀧為你解決問題！  一年十三組的黑神目瀧入選成為箱庭學園第98代學生會長，她在選舉戰中根據公約設立“意見箱”。  “你們的夢想是你們自己的所有物，自己挑戰就要自己實現，但是，你們的煩惱是我的所有物，一點不剩全部交給我吧！！！”  於是，黑神和她的青梅竹馬“人吉善吉”開始共同解決學生們投遞的案件。意見箱人送外號“黑神箱”，獲得學生們一致好評，但是……